Tumorgenomikk

Ved Tumorgenomikk nyttar vi arvestoffbaserte teknikkar, altså analysar av DNA og RNA, for å diagnostisere sjukdom.

Små mengder arvestoff blir isolert frå vevsprøver som er innsende til Avdeling for patologi. Ved hjelp av teknikken PCR kopierer vi opp det området av DNA-molekylet som er interessant, og deretter vert dette undersøkt for genfeil (mutasjonar). For å synleggjere mutasjonane nyttar vi metodar som gel-elektroforese, sanntids-PCR og DNA-sekvensering.

Arbeidet ved laboratoriet vårt er i første rekke knytt til kreftdiagnostikk. Prøvesvara kan seie noko om pasienten har kreft eller ein godarta tilstand, kva type kreft pasienten eventuelt har, og kva behandling han/ho i så fall bør få. Ikkje minst har det dei siste åra vore ein stor auke i analysar som avgjer bruk av nye, målretta medikament i behandling av visse typar svulstar.

Ved Eining for tumorgenomikk arbeidar bioingeniørar, molekylærbiologar, professor og patologar. Vi har tett samarbeid med Avdeling for patologi, og jobbar i hovudsak med følgjande problemstillingar:

• PCR, fragmentanalysar, Sanger-sekvensering og djupsekvensering (NGS) av kreftsvulstar for å sjå på genetiske endringar på nukleinsyrenivå.
• Multipleks digital kvantifisering (Nanostring) av RNA-uttrykk hjå kreftsvulstar for å sjå på genetiske endringar på nukleinsyrenivå.
• Fluorescens in situ hybridisering (FISH) av kreftsvulstar for å sjå på genetiske endringar på kromosomnivå.